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Head_CT_Morph/使用说明.md
2026-05-02 17:40:07 +08:00

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头颈部 CT 仰头形变工具使用说明

1. 工具用途

本工具用于将一组头颈部 CT DICOM 序列模拟成“仰头/后伸”状态,并输出新的 DICOM 序列和一张前后对比图。

适用场景:

  • PPT 展示
  • 方法演示
  • 头颈部体位变化的初步可视化
  • 插管体位下的仰头效果模拟

注意:本工具生成的是模拟形变结果,不应直接作为临床诊断或治疗计划依据。

2. 文件说明

用户版文件夹内包含:

  • 启动头颈CT仰头形变工具.bat:双击启动程序
  • head_extension_app.py:主程序
  • generate_head_extension_video.py:视频生成脚本
  • video_generator_app.py:视频生成图形界面
  • requirements.txtPython 依赖包列表
  • 使用说明.md:本说明文档
  • 生成0到20度仰头视频.bat:生成角度连续变化视频

3. 运行环境

需要安装 Python 3.8 或以上版本。

首次使用前,在当前文件夹打开命令行,执行:

pip install -r requirements.txt

如果已经在原电脑环境中配置好依赖,可直接双击启动。

4. 启动程序

双击:

启动头颈CT仰头形变工具.bat

若窗口没有打开,请在命令行中运行:

python head_extension_app.py

这样可以看到具体报错信息。

5. 输入数据要求

请选择一个只包含同一套 CT 序列 .dcm 文件的文件夹。

建议:

  • 使用轴位 CT 序列
  • 同一文件夹内不要混入多个 series
  • 文件扩展名最好为 .dcm
  • 推荐使用层厚较薄、覆盖完整头颈部的序列

6. 操作步骤

  1. 点击“选择”,选择输入 DICOM 文件夹。
  2. 点击“选择”,选择输出文件夹。
  3. 调节“仰头角度”滑块。
  4. 调节“过渡平滑宽度”滑块。
  5. 点击“更新预览”查看快速示意。
  6. 点击“生成形变 DICOM”。
  7. 等待完成提示。

7. 参数说明

仰头角度

控制头部后伸程度。

建议范围:

  • :轻微仰头
  • 10°-15°:较明显仰头
  • 20°:展示效果较强

过渡平滑宽度

控制头部旋转区域和肩颈固定区域之间的过渡范围。

建议:

  • 默认 90
  • 如果连接处仍有割裂感,可增大到 110-140
  • 如果整体形变过软,可减小到 60-80
  • 不建议使用过小数值,否则颈椎附近可能出现上下两段不连续的视觉效果

8. 输出结果

程序会在输出文件夹中生成:

  • ct_original/:原始 Original 完整 DICOM 序列
  • ct_hard_boundary/:硬边界 Hard boundary 完整 DICOM 序列
  • ct_gaussian_smooth/:高斯平滑 Gaussian smooth 完整 DICOM 序列
  • ct_soft_transition/:软过渡 Soft transition 完整 DICOM 序列
  • ct/:兼容旧版本的软过渡 Soft transition DICOM 序列
  • process_comparison_4states.png:四种状态过程对比图
  • process_screenshots/:四种状态的单独截图
  • before_after_preview.png:前后对比图

其中各个 ct_* 文件夹均可用 DICOM 查看器打开,也可作为后续 CT 三维重建的数据基础。

9. 常见问题

预览和最终 DICOM 完全一样吗?

不完全一样。

预览是快速 2D 示意,用于快速查看角度方向和大致效果;最终输出 DICOM 使用三维软过渡位移场生成。

为什么输出需要一段时间?

程序需要读取 CT、生成三维位移场、重采样体数据并重新写出 DICOM。300 层 CT 通常需要 1-3 分钟。

为什么连接处仍可能有轻微不自然?

目前方法使用软过渡位移场模拟头颈后伸,不是完整的多节颈椎生物力学模型。如果需要更真实的临床级结果,需要进一步标注各颈椎旋转中心并建立多段运动模型。

中文路径会不会影响运行?

程序内部会自动把临时文件放到系统英文临时目录,尽量避免中文路径导致的第三方库兼容问题。输入和输出路径可以使用中文。

10. 推荐展示设置

用于 PPT 展示时,建议:

  • 仰头角度:12°-20°
  • 过渡平滑宽度:90-120
  • 使用输出的 process_comparison_4states.pngbefore_after_preview.png

如果希望展示角度连续变化,可另行生成视频动画。

11. 生成 0° 到 20° 连续变化视频

用户版文件夹内提供了视频生成功能,可生成一段从 平滑变化到 20° 的仰头动画。

双击:

生成0到20度仰头视频.bat

程序会打开一个视频生成窗口。

在窗口中可以:

  • 选择 DICOM 文件夹
  • 选择输出视频位置
  • 调节最大仰头角度
  • 调节动画时长
  • 点击“生成视频”

生成的视频位于:

ppt_video\head_extension_0_to_20deg.mp4

视频参数:

  • 分辨率:1920 × 1080
  • 帧率:30 fps
  • 动画时长:约 7 秒
  • 内容:左侧为原始 0° 图像,右侧为从 0° 平滑变化到 20° 的仰头效果

自定义视频角度和时长

不需要使用命令行。

在视频生成窗口中直接拖动滑块即可:

  • “最大仰头角度”:控制视频最终达到的角度
  • “动画时长”:控制从 0° 变化到最大角度所需时间

视频生成方式说明

视频使用轻量二维软弯曲预览算法生成,目的是用于 PPT 展示角度连续变化。它不会为每一帧重新生成完整三维 DICOM因此速度较快。

如果需要生成某一个具体角度下的完整 DICOM 结果,请使用主程序 启动头颈CT仰头形变工具.bat