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2026-06-11 03:33:14 +08:00

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Obsidian 项目知识库配置指南

Claude Scholar 内置了 Obsidian 研究知识库工作流，不需要 MCP，也不需要 API key。

这套工作流提供什么

Obsidian 在这里不是单纯的论文库，而是研究项目的默认知识层，可以统一沉淀：

稳定的项目背景与研究问题
论文笔记与文献综合
实验 runbook 与结果总结
每日研究日志、scratch notes 与同步队列
草稿、slides、proposal、rebuttal 等写作资产
不应继续留在主工作面的历史知识

Requirements

Required

一个本地 Obsidian vault 路径
通过环境变量设置 OBSIDIAN_VAULT_PATH，或在 bootstrap 时显式传入

Optional

安装并打开 Obsidian Desktop，便于跳转与查看
可用的 obsidian CLI，用于 open/search/daily 等辅助操作
OBSIDIAN_VAULT_NAME，便于生成更干净的 obsidian:// 链接和 CLI targeting

内置 skills

Claude Scholar 内置了面向项目作用域的 Obsidian KB 工作流。

默认主线最相关的是：

obsidian-project-kb-core
obsidian-source-ingestion
obsidian-literature-workflow
obsidian-kb-artifacts
defuddle

默认工作流不依赖 .base、MCP 或 API 服务。默认自动维护的图谱产物只有 Maps/literature.canvas；其他 .base 视图或项目/实验 canvas 都是 explicit-only。

默认行为

当 Claude Scholar 运行在一个包含 .claude/project-memory/registry.yaml 的仓库里时，应默认把这个仓库视为已经绑定到 Obsidian 项目知识库，并在任务过程中自动维护它。

如果仓库还没有绑定，但看起来像研究项目（例如包含 .git、README.md、docs/、notes/、plan/、results/、outputs/、src/ 或 scripts/），Claude Scholar 应自动 bootstrap 一个项目知识库。

Vault 中的默认目录结构

Research/{project-slug}/
  00-Hub.md
  01-Plan.md
  02-Index.md
  Sources/
    Papers/
    Web/
    Docs/
    Data/
    Interviews/
    Notes/
  Knowledge/
  Experiments/
  Results/
    Reports/
  Writing/
  Daily/
  Maps/
  Archive/
  _system/
    registry.md
    schema.md
    lint-report.md

常见生成文件包括：

02-Index.md
_system/registry.md
_system/schema.md
_system/lint-report.md
.claude/project-memory/{project_id}.md
文献工作流需要时生成 Maps/literature.canvas

Repo-local binding metadata

每个研究仓库都会在本地维护：

.claude/project-memory/
  registry.yaml
  {project_id}.md

registry.yaml 存 repo ↔ vault 的绑定关系
{project_id}.md 存 assistant-facing 的运行时项目记忆

笔记语言

生成和同步笔记时，语言按以下优先级解析：

.claude/project-memory/registry.yaml 中的项目配置
环境变量 OBSIDIAN_NOTE_LANGUAGE
默认 en

注意：registry.yaml 仍然只是 repo-local runtime binding 文件。项目内真正可见的 source of truth 仍然是 _system/registry.md。

支持的值：

en
zh-CN

主命令

/kb-init — 初始化 vault-first 项目知识库
/kb-status — 汇总当前已绑定 KB 的状态
/kb-ingest — 将新的 source material 路由到 canonical notes
/kb-log — 更新当天 Daily/ 和相关项目表面
/kb-sync — 运行确定性的 KB 维护并重同步项目表面
/kb-links — 修复或增强 canonical notes 之间的 wikilink
/kb-promote — 将稳定内容提升为 canonical note
/kb-index — 重建 02-Index.md
/kb-lint — 运行确定性的 KB 健康检查并重写 _system/lint-report.md
/kb-archive — 归档、detach、purge 或重命名 KB 对象
/kb-map — 在默认 literature canvas 之外按需生成 artifact
/kb-literature-review — 从 Sources/Papers 合成文献并写入 Knowledge、Writing、Maps/literature.canvas

已绑定仓库的最小维护面

当仓库已经通过 .claude/project-memory/registry.yaml 绑定时，Claude Scholar 应保持保守维护：

只要研究状态发生变化，就检查 Daily/YYYY-MM-DD.md
只有项目顶层状态真正变化时才更新 00-Hub.md
只要项目状态变化，就更新 .claude/project-memory/{project_id}.md
Knowledge/、Experiments/、Results/、Writing/ 默认保持 agent-first，而不是每轮都自动重写

可选的 Obsidian CLI 安装

官方 Obsidian CLI 是内置在较新的桌面版安装器里的。要使用 obsidian ... 命令：

使用支持 CLI 注册的 Obsidian Desktop 版本。
在 Obsidian Desktop 中打开 Settings -> General -> Advanced。
打开 Command line interface。
在 macOS 上确保 /Applications/Obsidian.app/Contents/MacOS 已加入 PATH（例如写入 ~/.zprofile）。
重启终端后验证：

obsidian help
obsidian search query="diffusion" limit=5

如果提示 Command line interface is not enabled，通常说明 shell 路径已经配置好，但 Obsidian 应用内的开关还没打开。

Lifecycle actions

Detach

停止自动同步
保留 vault 内容
保留 project memory 文件

Purge

永久删除 binding、project memory 和 vault 中的项目目录
只有在用户明确要求永久删除时才使用

可选的 CLI 与 URI 用法

Claude Scholar 可选使用官方 Obsidian CLI 与 URI：

CLI 文档：https://help.obsidian.md/cli
URI 文档：https://help.obsidian.md/uri

Troubleshooting

问题	解决方式
Bootstrap 缺少 vault path	设置 `OBSIDIAN_VAULT_PATH` 或显式传入 vault path
项目反复重新导入	检查 `.claude/project-memory/registry.yaml` 是否存在且 repo root 正确
vault 里仍出现旧目录拓扑	那通常来自旧文档或旧项目生成；当前默认结构以上述目录为准，默认只自动维护 `Maps/literature.canvas`
CLI 命令失败	检查 `Settings -> General -> Advanced -> Command line interface` 是否已打开；否则继续使用 filesystem-only sync
“删除项目知识” 看起来过于危险	优先使用 archive 或 detach；purge 仅用于永久删除

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